Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
Chrna4O70174 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Chrna4O70174 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Chrna4O70174 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Chrna4O70174 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Chrna4O70174 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Chrna4O70174 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
Chrna4O70174 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Chrna4O70174 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Chrna4O70174 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Chrna4O70174 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Chrna4O70174 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Chrna4O70174 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Chrna4O70174 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Chrna4O70174 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Chrna4O70174 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Chrna4O70174 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Chrna4O70174 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Chrna4O70174 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Chrna4O70174 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Chrna4O70174 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Chrna4O70174 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Chrna4O70174 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Chrna4O70174 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Chrna4O70174 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Chrna4O70174 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Chrna4O70174 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Chrna4O70174 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Chrna4O70174 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Chrna4O70174 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Chrna4O70174 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Chrna4O70174 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Chrna4O70174 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Chrna4O70174 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Chrna4O70174 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Chrna4O70174 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Chrna4O70174 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Chrna4O70174 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Chrna4O70174 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Chrna4O70174 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Chrna4O70174 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Chrna4O70174 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Chrna4O70174 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Chrna4O70174 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Chrna4O70174 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Chrna4O70174 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Chrna4O70174 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Chrna4O70174 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Chrna4O70174 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Chrna4O70174 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Chrna4O70174 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Chrna4O70174 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Chrna4O70174 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Chrna4O70174 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Chrna4O70174 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Chrna4O70174 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Chrna4O70174 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Chrna4O70174 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Chrna4O70174 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Chrna4O70174 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Chrna4O70174 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Chrna4O70174 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Chrna4O70174 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Chrna4O70174 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Chrna4O70174 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Chrna4O70174 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Chrna4O70174 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Chrna4O70174 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Chrna4O70174 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Chrna4O70174 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Chrna4O70174 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Chrna4O70174 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Chrna4O70174 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Chrna4O70174 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Chrna4O70174 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Chrna4O70174 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Chrna4O70174 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Chrna4O70174 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Chrna4O70174 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Chrna4O70174 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Chrna4O70174 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Chrna4O70174 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Chrna4O70174 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Chrna4O70174 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Chrna4O70174 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Chrna4O70174 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Chrna4O70174 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Chrna4O70174 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Chrna4O70174 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Chrna4O70174 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Chrna4O70174 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Chrna4O70174 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Chrna4O70174 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Chrna4O70174 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Chrna4O70174 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Chrna4O70174 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chrna4O70174 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chrna4O70174 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Chrna4O70174 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Chrna4O70174 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms