Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rad51dO55230 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rad51dO55230 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rad51dO55230 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rad51dO55230 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rad51dO55230 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rad51dO55230 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rad51dO55230 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rad51dO55230 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rad51dO55230 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rad51dO55230 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rad51dO55230 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rad51dO55230 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rad51dO55230 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rad51dO55230 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rad51dO55230 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad51dO55230 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad51dO55230 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad51dO55230 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad51dO55230 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad51dO55230 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad51dO55230 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad51dO55230 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad51dO55230 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad51dO55230 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad51dO55230 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad51dO55230 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad51dO55230 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad51dO55230 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad51dO55230 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad51dO55230 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad51dO55230 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rad51dO55230 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rad51dO55230 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rad51dO55230 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rad51dO55230 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad51dO55230 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad51dO55230 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad51dO55230 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad51dO55230 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad51dO55230 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad51dO55230 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rad51dO55230 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rad51dO55230 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rad51dO55230 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rad51dO55230 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad51dO55230 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad51dO55230 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad51dO55230 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rad51dO55230 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rad51dO55230 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad51dO55230 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad51dO55230 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad51dO55230 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad51dO55230 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rad51dO55230 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rad51dO55230 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rad51dO55230 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rad51dO55230 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rad51dO55230 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rad51dO55230 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rad51dO55230 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rad51dO55230 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rad51dO55230 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rad51dO55230 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rad51dO55230 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rad51dO55230 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad51dO55230 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad51dO55230 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad51dO55230 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad51dO55230 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad51dO55230 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad51dO55230 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad51dO55230 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad51dO55230 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad51dO55230 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad51dO55230 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad51dO55230 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad51dO55230 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad51dO55230 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad51dO55230 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad51dO55230 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad51dO55230 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad51dO55230 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad51dO55230 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad51dO55230 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad51dO55230 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad51dO55230 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad51dO55230 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad51dO55230 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad51dO55230 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad51dO55230 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad51dO55230 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad51dO55230 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad51dO55230 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad51dO55230 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad51dO55230 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad51dO55230 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad51dO55230 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad51dO55230 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms