Protein–RNA interactions for Protein: O55226

Chad, Chondroadherin, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChadO55226 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ChadO55226 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ChadO55226 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ChadO55226 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ChadO55226 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ChadO55226 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ChadO55226 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ChadO55226 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ChadO55226 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ChadO55226 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ChadO55226 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ChadO55226 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ChadO55226 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ChadO55226 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ChadO55226 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ChadO55226 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ChadO55226 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ChadO55226 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ChadO55226 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ChadO55226 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ChadO55226 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ChadO55226 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ChadO55226 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ChadO55226 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ChadO55226 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ChadO55226 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ChadO55226 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ChadO55226 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ChadO55226 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ChadO55226 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ChadO55226 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ChadO55226 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ChadO55226 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ChadO55226 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ChadO55226 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ChadO55226 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ChadO55226 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ChadO55226 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ChadO55226 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ChadO55226 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ChadO55226 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ChadO55226 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ChadO55226 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ChadO55226 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ChadO55226 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ChadO55226 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ChadO55226 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ChadO55226 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ChadO55226 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ChadO55226 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ChadO55226 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ChadO55226 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ChadO55226 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ChadO55226 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ChadO55226 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ChadO55226 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ChadO55226 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ChadO55226 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ChadO55226 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ChadO55226 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ChadO55226 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ChadO55226 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ChadO55226 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ChadO55226 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ChadO55226 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ChadO55226 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ChadO55226 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ChadO55226 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ChadO55226 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ChadO55226 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ChadO55226 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ChadO55226 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ChadO55226 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ChadO55226 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ChadO55226 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ChadO55226 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ChadO55226 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ChadO55226 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ChadO55226 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ChadO55226 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ChadO55226 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ChadO55226 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ChadO55226 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ChadO55226 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ChadO55226 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ChadO55226 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ChadO55226 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ChadO55226 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ChadO55226 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ChadO55226 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ChadO55226 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ChadO55226 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ChadO55226 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ChadO55226 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ChadO55226 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ChadO55226 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ChadO55226 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ChadO55226 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ChadO55226 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ChadO55226 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms