Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pja1O55176 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pja1O55176 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pja1O55176 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pja1O55176 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pja1O55176 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pja1O55176 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pja1O55176 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Pja1O55176 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pja1O55176 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pja1O55176 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pja1O55176 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pja1O55176 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pja1O55176 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pja1O55176 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pja1O55176 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pja1O55176 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pja1O55176 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pja1O55176 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Pja1O55176 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pja1O55176 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pja1O55176 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pja1O55176 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pja1O55176 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pja1O55176 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pja1O55176 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pja1O55176 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pja1O55176 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Pja1O55176 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pja1O55176 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pja1O55176 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pja1O55176 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pja1O55176 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pja1O55176 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pja1O55176 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pja1O55176 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pja1O55176 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pja1O55176 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pja1O55176 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pja1O55176 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pja1O55176 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pja1O55176 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pja1O55176 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pja1O55176 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pja1O55176 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pja1O55176 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pja1O55176 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pja1O55176 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pja1O55176 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pja1O55176 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Pja1O55176 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pja1O55176 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pja1O55176 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pja1O55176 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pja1O55176 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pja1O55176 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pja1O55176 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pja1O55176 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Pja1O55176 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pja1O55176 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pja1O55176 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pja1O55176 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pja1O55176 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pja1O55176 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pja1O55176 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pja1O55176 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pja1O55176 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pja1O55176 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pja1O55176 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pja1O55176 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pja1O55176 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pja1O55176 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pja1O55176 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pja1O55176 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pja1O55176 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pja1O55176 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pja1O55176 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pja1O55176 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pja1O55176 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pja1O55176 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pja1O55176 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pja1O55176 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pja1O55176 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pja1O55176 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pja1O55176 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pja1O55176 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pja1O55176 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pja1O55176 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pja1O55176 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pja1O55176 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pja1O55176 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pja1O55176 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pja1O55176 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pja1O55176 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pja1O55176 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pja1O55176 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pja1O55176 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pja1O55176 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pja1O55176 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pja1O55176 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms