Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Syngr1O55100 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Syngr1O55100 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Syngr1O55100 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Syngr1O55100 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Syngr1O55100 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Syngr1O55100 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Syngr1O55100 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Syngr1O55100 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syngr1O55100 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syngr1O55100 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syngr1O55100 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Syngr1O55100 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Syngr1O55100 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Syngr1O55100 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Syngr1O55100 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Syngr1O55100 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Syngr1O55100 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Syngr1O55100 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Syngr1O55100 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Syngr1O55100 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Syngr1O55100 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Syngr1O55100 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Syngr1O55100 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Syngr1O55100 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Syngr1O55100 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Syngr1O55100 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Syngr1O55100 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Syngr1O55100 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Syngr1O55100 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Syngr1O55100 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Syngr1O55100 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Syngr1O55100 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Syngr1O55100 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Syngr1O55100 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Syngr1O55100 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Syngr1O55100 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Syngr1O55100 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Syngr1O55100 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Syngr1O55100 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Syngr1O55100 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Syngr1O55100 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Syngr1O55100 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Syngr1O55100 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Syngr1O55100 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Syngr1O55100 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Syngr1O55100 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Syngr1O55100 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Syngr1O55100 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syngr1O55100 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syngr1O55100 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syngr1O55100 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syngr1O55100 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syngr1O55100 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syngr1O55100 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syngr1O55100 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syngr1O55100 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Syngr1O55100 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Syngr1O55100 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Syngr1O55100 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Syngr1O55100 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syngr1O55100 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syngr1O55100 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syngr1O55100 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syngr1O55100 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syngr1O55100 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Syngr1O55100 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Syngr1O55100 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Syngr1O55100 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Syngr1O55100 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Syngr1O55100 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Syngr1O55100 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Syngr1O55100 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Syngr1O55100 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Syngr1O55100 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Syngr1O55100 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Syngr1O55100 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Syngr1O55100 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syngr1O55100 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syngr1O55100 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syngr1O55100 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Syngr1O55100 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syngr1O55100 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Syngr1O55100 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Syngr1O55100 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syngr1O55100 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syngr1O55100 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syngr1O55100 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syngr1O55100 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syngr1O55100 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syngr1O55100 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syngr1O55100 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syngr1O55100 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Syngr1O55100 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Syngr1O55100 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syngr1O55100 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syngr1O55100 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syngr1O55100 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syngr1O55100 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Syngr1O55100 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms