Protein–RNA interactions for Protein: O35367

Kera, Keratocan, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KeraO35367 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KeraO35367 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KeraO35367 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KeraO35367 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KeraO35367 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KeraO35367 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KeraO35367 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KeraO35367 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KeraO35367 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KeraO35367 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KeraO35367 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KeraO35367 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KeraO35367 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KeraO35367 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KeraO35367 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KeraO35367 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KeraO35367 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KeraO35367 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KeraO35367 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KeraO35367 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KeraO35367 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KeraO35367 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KeraO35367 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KeraO35367 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KeraO35367 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KeraO35367 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KeraO35367 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KeraO35367 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KeraO35367 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KeraO35367 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KeraO35367 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KeraO35367 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KeraO35367 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KeraO35367 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KeraO35367 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KeraO35367 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KeraO35367 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KeraO35367 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KeraO35367 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KeraO35367 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KeraO35367 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KeraO35367 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KeraO35367 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KeraO35367 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KeraO35367 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KeraO35367 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KeraO35367 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KeraO35367 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KeraO35367 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KeraO35367 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KeraO35367 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KeraO35367 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KeraO35367 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KeraO35367 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KeraO35367 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KeraO35367 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KeraO35367 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KeraO35367 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KeraO35367 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KeraO35367 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KeraO35367 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KeraO35367 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KeraO35367 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KeraO35367 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KeraO35367 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KeraO35367 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KeraO35367 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KeraO35367 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KeraO35367 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KeraO35367 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KeraO35367 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KeraO35367 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KeraO35367 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KeraO35367 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KeraO35367 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KeraO35367 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KeraO35367 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KeraO35367 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KeraO35367 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KeraO35367 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KeraO35367 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KeraO35367 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KeraO35367 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KeraO35367 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KeraO35367 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KeraO35367 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KeraO35367 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KeraO35367 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KeraO35367 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KeraO35367 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KeraO35367 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KeraO35367 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KeraO35367 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KeraO35367 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KeraO35367 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KeraO35367 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KeraO35367 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KeraO35367 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KeraO35367 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KeraO35367 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms