Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nedd9O35177 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nedd9O35177 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nedd9O35177 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nedd9O35177 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nedd9O35177 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nedd9O35177 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nedd9O35177 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nedd9O35177 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nedd9O35177 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nedd9O35177 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nedd9O35177 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nedd9O35177 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nedd9O35177 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nedd9O35177 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nedd9O35177 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nedd9O35177 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nedd9O35177 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nedd9O35177 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nedd9O35177 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nedd9O35177 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nedd9O35177 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nedd9O35177 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nedd9O35177 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nedd9O35177 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nedd9O35177 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Nedd9O35177 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nedd9O35177 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nedd9O35177 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nedd9O35177 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nedd9O35177 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nedd9O35177 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nedd9O35177 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nedd9O35177 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nedd9O35177 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nedd9O35177 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nedd9O35177 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nedd9O35177 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nedd9O35177 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nedd9O35177 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nedd9O35177 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nedd9O35177 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Nedd9O35177 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nedd9O35177 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nedd9O35177 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nedd9O35177 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nedd9O35177 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nedd9O35177 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nedd9O35177 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nedd9O35177 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nedd9O35177 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nedd9O35177 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nedd9O35177 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nedd9O35177 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nedd9O35177 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nedd9O35177 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nedd9O35177 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nedd9O35177 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nedd9O35177 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nedd9O35177 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nedd9O35177 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nedd9O35177 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nedd9O35177 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nedd9O35177 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nedd9O35177 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nedd9O35177 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nedd9O35177 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nedd9O35177 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nedd9O35177 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nedd9O35177 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nedd9O35177 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nedd9O35177 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nedd9O35177 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nedd9O35177 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nedd9O35177 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nedd9O35177 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nedd9O35177 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Nedd9O35177 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nedd9O35177 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nedd9O35177 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nedd9O35177 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nedd9O35177 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nedd9O35177 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nedd9O35177 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nedd9O35177 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nedd9O35177 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nedd9O35177 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nedd9O35177 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nedd9O35177 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Nedd9O35177 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nedd9O35177 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nedd9O35177 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nedd9O35177 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nedd9O35177 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nedd9O35177 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nedd9O35177 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nedd9O35177 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nedd9O35177 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nedd9O35177 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nedd9O35177 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
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