Protein–RNA interactions for Protein: O09102

Gcm2, Chorion-specific transcription factor GCMb, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcm2O09102 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Gcm2O09102 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gcm2O09102 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gcm2O09102 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gcm2O09102 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gcm2O09102 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gcm2O09102 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gcm2O09102 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gcm2O09102 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gcm2O09102 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gcm2O09102 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gcm2O09102 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gcm2O09102 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gcm2O09102 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gcm2O09102 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gcm2O09102 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gcm2O09102 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gcm2O09102 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gcm2O09102 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gcm2O09102 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gcm2O09102 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gcm2O09102 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gcm2O09102 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gcm2O09102 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gcm2O09102 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gcm2O09102 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gcm2O09102 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gcm2O09102 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gcm2O09102 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gcm2O09102 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gcm2O09102 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Gcm2O09102 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gcm2O09102 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gcm2O09102 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Gcm2O09102 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gcm2O09102 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gcm2O09102 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Gcm2O09102 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gcm2O09102 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gcm2O09102 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gcm2O09102 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gcm2O09102 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gcm2O09102 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gcm2O09102 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gcm2O09102 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gcm2O09102 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gcm2O09102 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gcm2O09102 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gcm2O09102 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gcm2O09102 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gcm2O09102 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gcm2O09102 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gcm2O09102 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gcm2O09102 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gcm2O09102 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gcm2O09102 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gcm2O09102 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gcm2O09102 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gcm2O09102 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gcm2O09102 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gcm2O09102 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gcm2O09102 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gcm2O09102 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gcm2O09102 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gcm2O09102 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gcm2O09102 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gcm2O09102 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gcm2O09102 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gcm2O09102 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Gcm2O09102 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gcm2O09102 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gcm2O09102 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gcm2O09102 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gcm2O09102 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gcm2O09102 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gcm2O09102 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gcm2O09102 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gcm2O09102 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gcm2O09102 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gcm2O09102 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gcm2O09102 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gcm2O09102 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gcm2O09102 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gcm2O09102 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gcm2O09102 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gcm2O09102 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gcm2O09102 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gcm2O09102 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gcm2O09102 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gcm2O09102 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Gcm2O09102 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gcm2O09102 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gcm2O09102 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gcm2O09102 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gcm2O09102 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gcm2O09102 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gcm2O09102 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gcm2O09102 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gcm2O09102 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gcm2O09102 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms