Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21887J3QQ04 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21887J3QQ04 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21887J3QQ04 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21887J3QQ04 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21887J3QQ04 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21887J3QQ04 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21887J3QQ04 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21887J3QQ04 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21887J3QQ04 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21887J3QQ04 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21887J3QQ04 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21887J3QQ04 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21887J3QQ04 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21887J3QQ04 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21887J3QQ04 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21887J3QQ04 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21887J3QQ04 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21887J3QQ04 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21887J3QQ04 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21887J3QQ04 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21887J3QQ04 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21887J3QQ04 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21887J3QQ04 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21887J3QQ04 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21887J3QQ04 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21887J3QQ04 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21887J3QQ04 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21887J3QQ04 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21887J3QQ04 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21887J3QQ04 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21887J3QQ04 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21887J3QQ04 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21887J3QQ04 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21887J3QQ04 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21887J3QQ04 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21887J3QQ04 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21887J3QQ04 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21887J3QQ04 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21887J3QQ04 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21887J3QQ04 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21887J3QQ04 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21887J3QQ04 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21887J3QQ04 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21887J3QQ04 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21887J3QQ04 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21887J3QQ04 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm21887J3QQ04 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21887J3QQ04 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21887J3QQ04 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21887J3QQ04 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21887J3QQ04 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21887J3QQ04 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21887J3QQ04 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21887J3QQ04 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21887J3QQ04 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21887J3QQ04 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21887J3QQ04 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21887J3QQ04 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21887J3QQ04 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21887J3QQ04 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21887J3QQ04 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21887J3QQ04 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21887J3QQ04 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21887J3QQ04 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21887J3QQ04 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21887J3QQ04 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21887J3QQ04 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21887J3QQ04 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21887J3QQ04 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21887J3QQ04 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21887J3QQ04 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21887J3QQ04 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21887J3QQ04 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21887J3QQ04 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21887J3QQ04 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm21887J3QQ04 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm21887J3QQ04 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21887J3QQ04 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21887J3QQ04 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21887J3QQ04 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21887J3QQ04 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21887J3QQ04 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21887J3QQ04 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21887J3QQ04 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21887J3QQ04 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21887J3QQ04 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21887J3QQ04 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21887J3QQ04 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21887J3QQ04 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21887J3QQ04 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21887J3QQ04 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21887J3QQ04 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21887J3QQ04 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21887J3QQ04 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21887J3QQ04 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21887J3QQ04 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21887J3QQ04 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21887J3QQ04 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21887J3QQ04 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms