Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm2056J3QQ02 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm2056J3QQ02 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm2056J3QQ02 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm2056J3QQ02 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm2056J3QQ02 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm2056J3QQ02 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm2056J3QQ02 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm2056J3QQ02 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm2056J3QQ02 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm2056J3QQ02 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm2056J3QQ02 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm2056J3QQ02 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm2056J3QQ02 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm2056J3QQ02 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm2056J3QQ02 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm2056J3QQ02 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm2056J3QQ02 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm2056J3QQ02 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm2056J3QQ02 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm2056J3QQ02 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm2056J3QQ02 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm2056J3QQ02 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm2056J3QQ02 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm2056J3QQ02 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm2056J3QQ02 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm2056J3QQ02 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm2056J3QQ02 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm2056J3QQ02 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm2056J3QQ02 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm2056J3QQ02 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Gm2056J3QQ02 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Gm2056J3QQ02 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm2056J3QQ02 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm2056J3QQ02 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm2056J3QQ02 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm2056J3QQ02 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm2056J3QQ02 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm2056J3QQ02 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm2056J3QQ02 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm2056J3QQ02 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm2056J3QQ02 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm2056J3QQ02 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm2056J3QQ02 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm2056J3QQ02 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm2056J3QQ02 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm2056J3QQ02 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm2056J3QQ02 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm2056J3QQ02 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm2056J3QQ02 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm2056J3QQ02 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm2056J3QQ02 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm2056J3QQ02 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm2056J3QQ02 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm2056J3QQ02 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm2056J3QQ02 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm2056J3QQ02 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm2056J3QQ02 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm2056J3QQ02 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm2056J3QQ02 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm2056J3QQ02 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm2056J3QQ02 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm2056J3QQ02 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm2056J3QQ02 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm2056J3QQ02 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm2056J3QQ02 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm2056J3QQ02 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm2056J3QQ02 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm2056J3QQ02 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm2056J3QQ02 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm2056J3QQ02 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm2056J3QQ02 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm2056J3QQ02 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm2056J3QQ02 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm2056J3QQ02 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm2056J3QQ02 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm2056J3QQ02 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm2056J3QQ02 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm2056J3QQ02 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm2056J3QQ02 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm2056J3QQ02 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm2056J3QQ02 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm2056J3QQ02 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm2056J3QQ02 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm2056J3QQ02 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm2056J3QQ02 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm2056J3QQ02 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm2056J3QQ02 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm2056J3QQ02 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm2056J3QQ02 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm2056J3QQ02 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm2056J3QQ02 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm2056J3QQ02 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm2056J3QQ02 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm2056J3QQ02 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm2056J3QQ02 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm2056J3QQ02 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm2056J3QQ02 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm2056J3QQ02 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm2056J3QQ02 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms