Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Ccer2J3QPU5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Ccer2J3QPU5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Ccer2J3QPU5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Ccer2J3QPU5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Ccer2J3QPU5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Ccer2J3QPU5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Ccer2J3QPU5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Ccer2J3QPU5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ccer2J3QPU5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ccer2J3QPU5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Ccer2J3QPU5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Ccer2J3QPU5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Ccer2J3QPU5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Ccer2J3QPU5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Ccer2J3QPU5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Ccer2J3QPU5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Ccer2J3QPU5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Ccer2J3QPU5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Ccer2J3QPU5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Ccer2J3QPU5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Ccer2J3QPU5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
Ccer2J3QPU5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Ccer2J3QPU5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Ccer2J3QPU5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Ccer2J3QPU5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Ccer2J3QPU5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Ccer2J3QPU5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Ccer2J3QPU5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Ccer2J3QPU5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Ccer2J3QPU5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Ccer2J3QPU5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Ccer2J3QPU5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Ccer2J3QPU5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Ccer2J3QPU5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Ccer2J3QPU5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Ccer2J3QPU5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Ccer2J3QPU5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Ccer2J3QPU5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Ccer2J3QPU5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Ccer2J3QPU5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Ccer2J3QPU5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Ccer2J3QPU5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Ccer2J3QPU5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Ccer2J3QPU5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Ccer2J3QPU5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Ccer2J3QPU5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Ccer2J3QPU5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Ccer2J3QPU5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Ccer2J3QPU5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Ccer2J3QPU5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Ccer2J3QPU5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Ccer2J3QPU5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Ccer2J3QPU5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
Ccer2J3QPU5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Ccer2J3QPU5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Ccer2J3QPU5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Ccer2J3QPU5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Ccer2J3QPU5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Ccer2J3QPU5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
Ccer2J3QPU5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
Ccer2J3QPU5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Ccer2J3QPU5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Ccer2J3QPU5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Ccer2J3QPU5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Ccer2J3QPU5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Ccer2J3QPU5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Ccer2J3QPU5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Ccer2J3QPU5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Ccer2J3QPU5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
Ccer2J3QPU5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Ccer2J3QPU5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Ccer2J3QPU5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Ccer2J3QPU5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Ccer2J3QPU5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Ccer2J3QPU5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
Ccer2J3QPU5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Ccer2J3QPU5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Ccer2J3QPU5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Ccer2J3QPU5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Ccer2J3QPU5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Ccer2J3QPU5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Ccer2J3QPU5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Ccer2J3QPU5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Ccer2J3QPU5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Ccer2J3QPU5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Ccer2J3QPU5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Ccer2J3QPU5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
Ccer2J3QPU5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Ccer2J3QPU5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Ccer2J3QPU5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Ccer2J3QPU5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Ccer2J3QPU5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Ccer2J3QPU5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Ccer2J3QPU5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Ccer2J3QPU5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Ccer2J3QPU5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
Ccer2J3QPU5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Ccer2J3QPU5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Ccer2J3QPU5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms