Protein–RNA interactions for Protein: H3BK29

Vmn2r6, Vomeronasal 2, receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r6H3BK29 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vmn2r6H3BK29 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vmn2r6H3BK29 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vmn2r6H3BK29 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vmn2r6H3BK29 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vmn2r6H3BK29 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vmn2r6H3BK29 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vmn2r6H3BK29 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vmn2r6H3BK29 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Vmn2r6H3BK29 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmn2r6H3BK29 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmn2r6H3BK29 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn2r6H3BK29 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn2r6H3BK29 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn2r6H3BK29 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn2r6H3BK29 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn2r6H3BK29 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn2r6H3BK29 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn2r6H3BK29 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vmn2r6H3BK29 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Vmn2r6H3BK29 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vmn2r6H3BK29 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vmn2r6H3BK29 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vmn2r6H3BK29 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vmn2r6H3BK29 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vmn2r6H3BK29 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vmn2r6H3BK29 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vmn2r6H3BK29 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vmn2r6H3BK29 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vmn2r6H3BK29 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vmn2r6H3BK29 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vmn2r6H3BK29 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vmn2r6H3BK29 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmn2r6H3BK29 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmn2r6H3BK29 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmn2r6H3BK29 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn2r6H3BK29 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn2r6H3BK29 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn2r6H3BK29 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn2r6H3BK29 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn2r6H3BK29 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn2r6H3BK29 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn2r6H3BK29 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn2r6H3BK29 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn2r6H3BK29 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn2r6H3BK29 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn2r6H3BK29 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn2r6H3BK29 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn2r6H3BK29 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn2r6H3BK29 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn2r6H3BK29 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn2r6H3BK29 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn2r6H3BK29 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn2r6H3BK29 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn2r6H3BK29 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn2r6H3BK29 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn2r6H3BK29 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn2r6H3BK29 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn2r6H3BK29 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn2r6H3BK29 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn2r6H3BK29 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn2r6H3BK29 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn2r6H3BK29 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn2r6H3BK29 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn2r6H3BK29 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn2r6H3BK29 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn2r6H3BK29 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn2r6H3BK29 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn2r6H3BK29 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn2r6H3BK29 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vmn2r6H3BK29 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn2r6H3BK29 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn2r6H3BK29 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn2r6H3BK29 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn2r6H3BK29 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn2r6H3BK29 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn2r6H3BK29 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn2r6H3BK29 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn2r6H3BK29 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn2r6H3BK29 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn2r6H3BK29 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn2r6H3BK29 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn2r6H3BK29 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn2r6H3BK29 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn2r6H3BK29 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn2r6H3BK29 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn2r6H3BK29 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn2r6H3BK29 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn2r6H3BK29 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn2r6H3BK29 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn2r6H3BK29 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn2r6H3BK29 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn2r6H3BK29 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn2r6H3BK29 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn2r6H3BK29 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn2r6H3BK29 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn2r6H3BK29 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn2r6H3BK29 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn2r6H3BK29 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn2r6H3BK29 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms