Protein–RNA interactions for Protein: G3X9N3

Pnmal2, MCG16539, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnmal2G3X9N3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Pnmal2G3X9N3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Pnmal2G3X9N3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Pnmal2G3X9N3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Pnmal2G3X9N3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Pnmal2G3X9N3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Pnmal2G3X9N3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Pnmal2G3X9N3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Pnmal2G3X9N3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Pnmal2G3X9N3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Pnmal2G3X9N3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Pnmal2G3X9N3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Pnmal2G3X9N3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Pnmal2G3X9N3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Pnmal2G3X9N3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Pnmal2G3X9N3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Pnmal2G3X9N3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Pnmal2G3X9N3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Pnmal2G3X9N3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Pnmal2G3X9N3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Pnmal2G3X9N3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Pnmal2G3X9N3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Pnmal2G3X9N3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Pnmal2G3X9N3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Pnmal2G3X9N3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Pnmal2G3X9N3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Pnmal2G3X9N3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Pnmal2G3X9N3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Pnmal2G3X9N3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Pnmal2G3X9N3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Pnmal2G3X9N3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Pnmal2G3X9N3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Pnmal2G3X9N3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Pnmal2G3X9N3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Pnmal2G3X9N3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Pnmal2G3X9N3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Pnmal2G3X9N3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Pnmal2G3X9N3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Pnmal2G3X9N3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Pnmal2G3X9N3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Pnmal2G3X9N3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Pnmal2G3X9N3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Pnmal2G3X9N3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Pnmal2G3X9N3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Pnmal2G3X9N3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Pnmal2G3X9N3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Pnmal2G3X9N3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Pnmal2G3X9N3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pnmal2G3X9N3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pnmal2G3X9N3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pnmal2G3X9N3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pnmal2G3X9N3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Pnmal2G3X9N3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Pnmal2G3X9N3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Pnmal2G3X9N3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Pnmal2G3X9N3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Pnmal2G3X9N3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Pnmal2G3X9N3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Pnmal2G3X9N3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Pnmal2G3X9N3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Pnmal2G3X9N3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Pnmal2G3X9N3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Pnmal2G3X9N3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Pnmal2G3X9N3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Pnmal2G3X9N3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Pnmal2G3X9N3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Pnmal2G3X9N3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Pnmal2G3X9N3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Pnmal2G3X9N3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Pnmal2G3X9N3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Pnmal2G3X9N3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Pnmal2G3X9N3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Pnmal2G3X9N3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Pnmal2G3X9N3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Pnmal2G3X9N3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Pnmal2G3X9N3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Pnmal2G3X9N3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Pnmal2G3X9N3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Pnmal2G3X9N3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Pnmal2G3X9N3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Pnmal2G3X9N3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Pnmal2G3X9N3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Pnmal2G3X9N3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Pnmal2G3X9N3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Pnmal2G3X9N3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Pnmal2G3X9N3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Pnmal2G3X9N3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Pnmal2G3X9N3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pnmal2G3X9N3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Pnmal2G3X9N3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pnmal2G3X9N3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pnmal2G3X9N3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pnmal2G3X9N3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Pnmal2G3X9N3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Pnmal2G3X9N3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Pnmal2G3X9N3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Pnmal2G3X9N3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Pnmal2G3X9N3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Pnmal2G3X9N3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Pnmal2G3X9N3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms