Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK8

Pcdh9, Protocadherin 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh9F8VPK8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcdh9F8VPK8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcdh9F8VPK8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcdh9F8VPK8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcdh9F8VPK8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcdh9F8VPK8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcdh9F8VPK8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcdh9F8VPK8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcdh9F8VPK8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pcdh9F8VPK8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pcdh9F8VPK8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcdh9F8VPK8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcdh9F8VPK8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcdh9F8VPK8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcdh9F8VPK8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcdh9F8VPK8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcdh9F8VPK8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcdh9F8VPK8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcdh9F8VPK8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcdh9F8VPK8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcdh9F8VPK8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcdh9F8VPK8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcdh9F8VPK8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcdh9F8VPK8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcdh9F8VPK8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcdh9F8VPK8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcdh9F8VPK8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcdh9F8VPK8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcdh9F8VPK8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcdh9F8VPK8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcdh9F8VPK8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcdh9F8VPK8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcdh9F8VPK8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcdh9F8VPK8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcdh9F8VPK8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcdh9F8VPK8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcdh9F8VPK8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcdh9F8VPK8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcdh9F8VPK8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcdh9F8VPK8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcdh9F8VPK8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcdh9F8VPK8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcdh9F8VPK8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcdh9F8VPK8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcdh9F8VPK8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcdh9F8VPK8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcdh9F8VPK8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcdh9F8VPK8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcdh9F8VPK8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcdh9F8VPK8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcdh9F8VPK8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcdh9F8VPK8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcdh9F8VPK8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcdh9F8VPK8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcdh9F8VPK8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcdh9F8VPK8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcdh9F8VPK8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcdh9F8VPK8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcdh9F8VPK8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcdh9F8VPK8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pcdh9F8VPK8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pcdh9F8VPK8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcdh9F8VPK8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcdh9F8VPK8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcdh9F8VPK8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcdh9F8VPK8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcdh9F8VPK8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcdh9F8VPK8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcdh9F8VPK8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcdh9F8VPK8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcdh9F8VPK8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcdh9F8VPK8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcdh9F8VPK8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcdh9F8VPK8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcdh9F8VPK8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcdh9F8VPK8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcdh9F8VPK8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcdh9F8VPK8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pcdh9F8VPK8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pcdh9F8VPK8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pcdh9F8VPK8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pcdh9F8VPK8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pcdh9F8VPK8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pcdh9F8VPK8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcdh9F8VPK8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcdh9F8VPK8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcdh9F8VPK8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcdh9F8VPK8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdh9F8VPK8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdh9F8VPK8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdh9F8VPK8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdh9F8VPK8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdh9F8VPK8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdh9F8VPK8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdh9F8VPK8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcdh9F8VPK8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcdh9F8VPK8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcdh9F8VPK8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcdh9F8VPK8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcdh9F8VPK8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms