Protein–RNA interactions for Protein: E9Q501

Gm2237, Predicted gene 2237, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2237E9Q501 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm2237E9Q501 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm2237E9Q501 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm2237E9Q501 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm2237E9Q501 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm2237E9Q501 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm2237E9Q501 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm2237E9Q501 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm2237E9Q501 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm2237E9Q501 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm2237E9Q501 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm2237E9Q501 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm2237E9Q501 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm2237E9Q501 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gm2237E9Q501 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm2237E9Q501 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm2237E9Q501 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm2237E9Q501 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm2237E9Q501 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm2237E9Q501 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm2237E9Q501 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm2237E9Q501 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm2237E9Q501 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm2237E9Q501 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm2237E9Q501 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm2237E9Q501 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm2237E9Q501 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm2237E9Q501 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm2237E9Q501 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm2237E9Q501 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm2237E9Q501 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm2237E9Q501 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm2237E9Q501 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm2237E9Q501 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm2237E9Q501 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm2237E9Q501 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm2237E9Q501 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm2237E9Q501 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm2237E9Q501 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm2237E9Q501 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm2237E9Q501 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm2237E9Q501 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm2237E9Q501 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm2237E9Q501 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm2237E9Q501 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm2237E9Q501 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm2237E9Q501 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm2237E9Q501 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm2237E9Q501 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm2237E9Q501 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm2237E9Q501 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm2237E9Q501 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm2237E9Q501 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm2237E9Q501 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm2237E9Q501 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm2237E9Q501 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm2237E9Q501 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm2237E9Q501 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm2237E9Q501 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm2237E9Q501 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm2237E9Q501 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm2237E9Q501 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm2237E9Q501 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm2237E9Q501 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm2237E9Q501 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm2237E9Q501 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm2237E9Q501 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm2237E9Q501 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm2237E9Q501 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm2237E9Q501 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm2237E9Q501 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm2237E9Q501 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm2237E9Q501 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm2237E9Q501 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm2237E9Q501 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm2237E9Q501 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm2237E9Q501 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm2237E9Q501 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm2237E9Q501 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm2237E9Q501 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm2237E9Q501 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm2237E9Q501 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm2237E9Q501 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm2237E9Q501 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm2237E9Q501 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm2237E9Q501 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm2237E9Q501 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm2237E9Q501 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm2237E9Q501 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm2237E9Q501 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm2237E9Q501 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm2237E9Q501 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm2237E9Q501 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm2237E9Q501 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm2237E9Q501 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm2237E9Q501 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm2237E9Q501 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm2237E9Q501 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm2237E9Q501 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm2237E9Q501 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms