Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3P4

Cenpf, Centromere protein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpfE9Q3P4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CenpfE9Q3P4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CenpfE9Q3P4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CenpfE9Q3P4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CenpfE9Q3P4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CenpfE9Q3P4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CenpfE9Q3P4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CenpfE9Q3P4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CenpfE9Q3P4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CenpfE9Q3P4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CenpfE9Q3P4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CenpfE9Q3P4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CenpfE9Q3P4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CenpfE9Q3P4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CenpfE9Q3P4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CenpfE9Q3P4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CenpfE9Q3P4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CenpfE9Q3P4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CenpfE9Q3P4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CenpfE9Q3P4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CenpfE9Q3P4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CenpfE9Q3P4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CenpfE9Q3P4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CenpfE9Q3P4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CenpfE9Q3P4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CenpfE9Q3P4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CenpfE9Q3P4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CenpfE9Q3P4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CenpfE9Q3P4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CenpfE9Q3P4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CenpfE9Q3P4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CenpfE9Q3P4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CenpfE9Q3P4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CenpfE9Q3P4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CenpfE9Q3P4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CenpfE9Q3P4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CenpfE9Q3P4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CenpfE9Q3P4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CenpfE9Q3P4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CenpfE9Q3P4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CenpfE9Q3P4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CenpfE9Q3P4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CenpfE9Q3P4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CenpfE9Q3P4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CenpfE9Q3P4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CenpfE9Q3P4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CenpfE9Q3P4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CenpfE9Q3P4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CenpfE9Q3P4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CenpfE9Q3P4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CenpfE9Q3P4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CenpfE9Q3P4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CenpfE9Q3P4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CenpfE9Q3P4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CenpfE9Q3P4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CenpfE9Q3P4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CenpfE9Q3P4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CenpfE9Q3P4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CenpfE9Q3P4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CenpfE9Q3P4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CenpfE9Q3P4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CenpfE9Q3P4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CenpfE9Q3P4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CenpfE9Q3P4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CenpfE9Q3P4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CenpfE9Q3P4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CenpfE9Q3P4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CenpfE9Q3P4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CenpfE9Q3P4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CenpfE9Q3P4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CenpfE9Q3P4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CenpfE9Q3P4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CenpfE9Q3P4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CenpfE9Q3P4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CenpfE9Q3P4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CenpfE9Q3P4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CenpfE9Q3P4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CenpfE9Q3P4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CenpfE9Q3P4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CenpfE9Q3P4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CenpfE9Q3P4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CenpfE9Q3P4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CenpfE9Q3P4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CenpfE9Q3P4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CenpfE9Q3P4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CenpfE9Q3P4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CenpfE9Q3P4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CenpfE9Q3P4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CenpfE9Q3P4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CenpfE9Q3P4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CenpfE9Q3P4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CenpfE9Q3P4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CenpfE9Q3P4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CenpfE9Q3P4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CenpfE9Q3P4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CenpfE9Q3P4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CenpfE9Q3P4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CenpfE9Q3P4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CenpfE9Q3P4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CenpfE9Q3P4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms