Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ddx60E9PZQ1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ddx60E9PZQ1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ddx60E9PZQ1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ddx60E9PZQ1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Ddx60E9PZQ1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ddx60E9PZQ1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ddx60E9PZQ1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ddx60E9PZQ1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ddx60E9PZQ1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ddx60E9PZQ1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ddx60E9PZQ1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ddx60E9PZQ1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ddx60E9PZQ1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Ddx60E9PZQ1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Ddx60E9PZQ1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ddx60E9PZQ1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
Ddx60E9PZQ1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ddx60E9PZQ1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ddx60E9PZQ1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ddx60E9PZQ1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ddx60E9PZQ1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ddx60E9PZQ1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ddx60E9PZQ1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ddx60E9PZQ1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ddx60E9PZQ1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ddx60E9PZQ1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ddx60E9PZQ1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ddx60E9PZQ1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ddx60E9PZQ1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ddx60E9PZQ1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ddx60E9PZQ1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ddx60E9PZQ1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Ddx60E9PZQ1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ddx60E9PZQ1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ddx60E9PZQ1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ddx60E9PZQ1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ddx60E9PZQ1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ddx60E9PZQ1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ddx60E9PZQ1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ddx60E9PZQ1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ddx60E9PZQ1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ddx60E9PZQ1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ddx60E9PZQ1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ddx60E9PZQ1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ddx60E9PZQ1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ddx60E9PZQ1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ddx60E9PZQ1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ddx60E9PZQ1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ddx60E9PZQ1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ddx60E9PZQ1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ddx60E9PZQ1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ddx60E9PZQ1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ddx60E9PZQ1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ddx60E9PZQ1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ddx60E9PZQ1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ddx60E9PZQ1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ddx60E9PZQ1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ddx60E9PZQ1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ddx60E9PZQ1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ddx60E9PZQ1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ddx60E9PZQ1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ddx60E9PZQ1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ddx60E9PZQ1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ddx60E9PZQ1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ddx60E9PZQ1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ddx60E9PZQ1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ddx60E9PZQ1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Ddx60E9PZQ1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Ddx60E9PZQ1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Ddx60E9PZQ1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Ddx60E9PZQ1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ddx60E9PZQ1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ddx60E9PZQ1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ddx60E9PZQ1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ddx60E9PZQ1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ddx60E9PZQ1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Ddx60E9PZQ1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ddx60E9PZQ1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ddx60E9PZQ1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ddx60E9PZQ1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ddx60E9PZQ1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ddx60E9PZQ1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ddx60E9PZQ1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ddx60E9PZQ1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ddx60E9PZQ1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Ddx60E9PZQ1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ddx60E9PZQ1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ddx60E9PZQ1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ddx60E9PZQ1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ddx60E9PZQ1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ddx60E9PZQ1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ddx60E9PZQ1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ddx60E9PZQ1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ddx60E9PZQ1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ddx60E9PZQ1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ddx60E9PZQ1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ddx60E9PZQ1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ddx60E9PZQ1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ddx60E9PZQ1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
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