Protein–RNA interactions for Protein: E9PUS4

Zfp944, Zinc finger protein 944, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp944E9PUS4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zfp944E9PUS4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp944E9PUS4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp944E9PUS4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp944E9PUS4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp944E9PUS4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp944E9PUS4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp944E9PUS4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp944E9PUS4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp944E9PUS4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp944E9PUS4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp944E9PUS4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp944E9PUS4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp944E9PUS4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp944E9PUS4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp944E9PUS4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp944E9PUS4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp944E9PUS4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp944E9PUS4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp944E9PUS4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp944E9PUS4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp944E9PUS4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp944E9PUS4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp944E9PUS4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp944E9PUS4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp944E9PUS4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp944E9PUS4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp944E9PUS4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp944E9PUS4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp944E9PUS4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp944E9PUS4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp944E9PUS4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp944E9PUS4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Zfp944E9PUS4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp944E9PUS4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp944E9PUS4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp944E9PUS4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp944E9PUS4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp944E9PUS4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Zfp944E9PUS4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp944E9PUS4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Zfp944E9PUS4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp944E9PUS4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp944E9PUS4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp944E9PUS4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp944E9PUS4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp944E9PUS4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp944E9PUS4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfp944E9PUS4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfp944E9PUS4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfp944E9PUS4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfp944E9PUS4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Zfp944E9PUS4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zfp944E9PUS4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zfp944E9PUS4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zfp944E9PUS4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zfp944E9PUS4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zfp944E9PUS4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zfp944E9PUS4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zfp944E9PUS4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Zfp944E9PUS4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zfp944E9PUS4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zfp944E9PUS4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zfp944E9PUS4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zfp944E9PUS4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zfp944E9PUS4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Zfp944E9PUS4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zfp944E9PUS4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Zfp944E9PUS4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Zfp944E9PUS4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zfp944E9PUS4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zfp944E9PUS4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zfp944E9PUS4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zfp944E9PUS4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zfp944E9PUS4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zfp944E9PUS4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zfp944E9PUS4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zfp944E9PUS4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zfp944E9PUS4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zfp944E9PUS4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp944E9PUS4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zfp944E9PUS4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zfp944E9PUS4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zfp944E9PUS4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zfp944E9PUS4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zfp944E9PUS4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zfp944E9PUS4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zfp944E9PUS4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zfp944E9PUS4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zfp944E9PUS4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zfp944E9PUS4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zfp944E9PUS4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zfp944E9PUS4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zfp944E9PUS4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zfp944E9PUS4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zfp944E9PUS4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zfp944E9PUS4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zfp944E9PUS4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zfp944E9PUS4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zfp944E9PUS4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms