Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klhl3E0CZ16 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klhl3E0CZ16 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klhl3E0CZ16 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Klhl3E0CZ16 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Klhl3E0CZ16 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Klhl3E0CZ16 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Klhl3E0CZ16 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Klhl3E0CZ16 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Klhl3E0CZ16 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Klhl3E0CZ16 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Klhl3E0CZ16 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Klhl3E0CZ16 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Klhl3E0CZ16 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Klhl3E0CZ16 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Klhl3E0CZ16 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Klhl3E0CZ16 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Klhl3E0CZ16 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Klhl3E0CZ16 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Klhl3E0CZ16 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Klhl3E0CZ16 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Klhl3E0CZ16 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klhl3E0CZ16 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klhl3E0CZ16 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klhl3E0CZ16 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klhl3E0CZ16 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klhl3E0CZ16 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klhl3E0CZ16 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klhl3E0CZ16 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Klhl3E0CZ16 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Klhl3E0CZ16 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Klhl3E0CZ16 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Klhl3E0CZ16 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Klhl3E0CZ16 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Klhl3E0CZ16 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Klhl3E0CZ16 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Klhl3E0CZ16 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Klhl3E0CZ16 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Klhl3E0CZ16 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Klhl3E0CZ16 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Klhl3E0CZ16 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Klhl3E0CZ16 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Klhl3E0CZ16 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Klhl3E0CZ16 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Klhl3E0CZ16 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Klhl3E0CZ16 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Klhl3E0CZ16 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Klhl3E0CZ16 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Klhl3E0CZ16 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Klhl3E0CZ16 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Klhl3E0CZ16 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Klhl3E0CZ16 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Klhl3E0CZ16 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Klhl3E0CZ16 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Klhl3E0CZ16 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Klhl3E0CZ16 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Klhl3E0CZ16 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Klhl3E0CZ16 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Klhl3E0CZ16 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Klhl3E0CZ16 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Klhl3E0CZ16 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Klhl3E0CZ16 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Klhl3E0CZ16 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Klhl3E0CZ16 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Klhl3E0CZ16 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Klhl3E0CZ16 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Klhl3E0CZ16 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Klhl3E0CZ16 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Klhl3E0CZ16 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klhl3E0CZ16 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klhl3E0CZ16 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klhl3E0CZ16 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klhl3E0CZ16 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klhl3E0CZ16 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Klhl3E0CZ16 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Klhl3E0CZ16 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klhl3E0CZ16 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klhl3E0CZ16 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Klhl3E0CZ16 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Klhl3E0CZ16 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Klhl3E0CZ16 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Klhl3E0CZ16 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Klhl3E0CZ16 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Klhl3E0CZ16 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Klhl3E0CZ16 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Klhl3E0CZ16 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl3E0CZ16 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl3E0CZ16 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl3E0CZ16 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klhl3E0CZ16 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klhl3E0CZ16 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhl3E0CZ16 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhl3E0CZ16 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhl3E0CZ16 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klhl3E0CZ16 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhl3E0CZ16 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhl3E0CZ16 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhl3E0CZ16 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhl3E0CZ16 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhl3E0CZ16 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms