Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Samd1D3YXK1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Samd1D3YXK1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Samd1D3YXK1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Samd1D3YXK1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Samd1D3YXK1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Samd1D3YXK1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Samd1D3YXK1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Samd1D3YXK1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Samd1D3YXK1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Samd1D3YXK1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Samd1D3YXK1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Samd1D3YXK1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Samd1D3YXK1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Samd1D3YXK1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Samd1D3YXK1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Samd1D3YXK1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Samd1D3YXK1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Samd1D3YXK1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Samd1D3YXK1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Samd1D3YXK1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Samd1D3YXK1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Samd1D3YXK1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Samd1D3YXK1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Samd1D3YXK1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Samd1D3YXK1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Samd1D3YXK1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Samd1D3YXK1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Samd1D3YXK1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Samd1D3YXK1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Samd1D3YXK1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Samd1D3YXK1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Samd1D3YXK1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Samd1D3YXK1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Samd1D3YXK1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Samd1D3YXK1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Samd1D3YXK1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Samd1D3YXK1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Samd1D3YXK1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Samd1D3YXK1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Samd1D3YXK1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Samd1D3YXK1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Samd1D3YXK1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Samd1D3YXK1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Samd1D3YXK1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Samd1D3YXK1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Samd1D3YXK1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Samd1D3YXK1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Samd1D3YXK1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Samd1D3YXK1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Samd1D3YXK1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Samd1D3YXK1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Samd1D3YXK1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Samd1D3YXK1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Samd1D3YXK1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Samd1D3YXK1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Samd1D3YXK1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Samd1D3YXK1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Samd1D3YXK1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Samd1D3YXK1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Samd1D3YXK1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Samd1D3YXK1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Samd1D3YXK1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Samd1D3YXK1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Samd1D3YXK1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Samd1D3YXK1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Samd1D3YXK1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Samd1D3YXK1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Samd1D3YXK1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Samd1D3YXK1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Samd1D3YXK1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Samd1D3YXK1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Samd1D3YXK1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Samd1D3YXK1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Samd1D3YXK1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Samd1D3YXK1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Samd1D3YXK1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Samd1D3YXK1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Samd1D3YXK1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Samd1D3YXK1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Samd1D3YXK1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Samd1D3YXK1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Samd1D3YXK1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Samd1D3YXK1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Samd1D3YXK1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Samd1D3YXK1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Samd1D3YXK1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Samd1D3YXK1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Samd1D3YXK1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Samd1D3YXK1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Samd1D3YXK1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Samd1D3YXK1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Samd1D3YXK1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Samd1D3YXK1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Samd1D3YXK1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Samd1D3YXK1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Samd1D3YXK1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Samd1D3YXK1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Samd1D3YXK1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Samd1D3YXK1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms