Protein–RNA interactions for Protein: B1AX30

1700031F05Rik, MCG116637, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700031F05RikB1AX30 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700031F05RikB1AX30 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700031F05RikB1AX30 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700031F05RikB1AX30 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
1700031F05RikB1AX30 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
1700031F05RikB1AX30 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
1700031F05RikB1AX30 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700031F05RikB1AX30 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700031F05RikB1AX30 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700031F05RikB1AX30 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700031F05RikB1AX30 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700031F05RikB1AX30 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700031F05RikB1AX30 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700031F05RikB1AX30 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700031F05RikB1AX30 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700031F05RikB1AX30 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700031F05RikB1AX30 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700031F05RikB1AX30 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700031F05RikB1AX30 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700031F05RikB1AX30 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700031F05RikB1AX30 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700031F05RikB1AX30 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700031F05RikB1AX30 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700031F05RikB1AX30 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700031F05RikB1AX30 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700031F05RikB1AX30 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700031F05RikB1AX30 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
1700031F05RikB1AX30 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
1700031F05RikB1AX30 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
1700031F05RikB1AX30 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700031F05RikB1AX30 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700031F05RikB1AX30 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700031F05RikB1AX30 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700031F05RikB1AX30 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700031F05RikB1AX30 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700031F05RikB1AX30 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700031F05RikB1AX30 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700031F05RikB1AX30 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700031F05RikB1AX30 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700031F05RikB1AX30 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700031F05RikB1AX30 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700031F05RikB1AX30 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700031F05RikB1AX30 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700031F05RikB1AX30 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700031F05RikB1AX30 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
1700031F05RikB1AX30 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700031F05RikB1AX30 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700031F05RikB1AX30 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700031F05RikB1AX30 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700031F05RikB1AX30 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700031F05RikB1AX30 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700031F05RikB1AX30 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700031F05RikB1AX30 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700031F05RikB1AX30 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700031F05RikB1AX30 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700031F05RikB1AX30 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700031F05RikB1AX30 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700031F05RikB1AX30 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700031F05RikB1AX30 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700031F05RikB1AX30 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700031F05RikB1AX30 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700031F05RikB1AX30 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
1700031F05RikB1AX30 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
1700031F05RikB1AX30 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700031F05RikB1AX30 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700031F05RikB1AX30 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700031F05RikB1AX30 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700031F05RikB1AX30 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700031F05RikB1AX30 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700031F05RikB1AX30 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700031F05RikB1AX30 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700031F05RikB1AX30 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700031F05RikB1AX30 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700031F05RikB1AX30 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700031F05RikB1AX30 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700031F05RikB1AX30 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700031F05RikB1AX30 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700031F05RikB1AX30 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700031F05RikB1AX30 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700031F05RikB1AX30 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700031F05RikB1AX30 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
1700031F05RikB1AX30 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700031F05RikB1AX30 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700031F05RikB1AX30 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700031F05RikB1AX30 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700031F05RikB1AX30 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700031F05RikB1AX30 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700031F05RikB1AX30 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700031F05RikB1AX30 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
1700031F05RikB1AX30 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
1700031F05RikB1AX30 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
1700031F05RikB1AX30 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
1700031F05RikB1AX30 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
1700031F05RikB1AX30 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
1700031F05RikB1AX30 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
1700031F05RikB1AX30 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
1700031F05RikB1AX30 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
1700031F05RikB1AX30 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
1700031F05RikB1AX30 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
1700031F05RikB1AX30 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms