Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Col4a6B1AVK5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Col4a6B1AVK5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Col4a6B1AVK5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Col4a6B1AVK5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Col4a6B1AVK5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Col4a6B1AVK5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Col4a6B1AVK5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Col4a6B1AVK5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Col4a6B1AVK5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Col4a6B1AVK5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Col4a6B1AVK5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Col4a6B1AVK5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Col4a6B1AVK5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Col4a6B1AVK5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col4a6B1AVK5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col4a6B1AVK5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col4a6B1AVK5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col4a6B1AVK5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col4a6B1AVK5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col4a6B1AVK5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col4a6B1AVK5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Col4a6B1AVK5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Col4a6B1AVK5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Col4a6B1AVK5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col4a6B1AVK5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col4a6B1AVK5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col4a6B1AVK5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col4a6B1AVK5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col4a6B1AVK5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col4a6B1AVK5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col4a6B1AVK5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col4a6B1AVK5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col4a6B1AVK5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col4a6B1AVK5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col4a6B1AVK5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col4a6B1AVK5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col4a6B1AVK5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col4a6B1AVK5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Col4a6B1AVK5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col4a6B1AVK5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col4a6B1AVK5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Col4a6B1AVK5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Col4a6B1AVK5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Col4a6B1AVK5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Col4a6B1AVK5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Col4a6B1AVK5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Col4a6B1AVK5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Col4a6B1AVK5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Col4a6B1AVK5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Col4a6B1AVK5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Col4a6B1AVK5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Col4a6B1AVK5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Col4a6B1AVK5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Col4a6B1AVK5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Col4a6B1AVK5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Col4a6B1AVK5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Col4a6B1AVK5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Col4a6B1AVK5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col4a6B1AVK5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col4a6B1AVK5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col4a6B1AVK5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col4a6B1AVK5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Col4a6B1AVK5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Col4a6B1AVK5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Col4a6B1AVK5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col4a6B1AVK5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col4a6B1AVK5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col4a6B1AVK5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Col4a6B1AVK5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col4a6B1AVK5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Col4a6B1AVK5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Col4a6B1AVK5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col4a6B1AVK5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col4a6B1AVK5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col4a6B1AVK5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Col4a6B1AVK5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Col4a6B1AVK5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Col4a6B1AVK5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col4a6B1AVK5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col4a6B1AVK5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col4a6B1AVK5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col4a6B1AVK5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col4a6B1AVK5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col4a6B1AVK5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Col4a6B1AVK5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Col4a6B1AVK5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Col4a6B1AVK5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Col4a6B1AVK5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col4a6B1AVK5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col4a6B1AVK5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col4a6B1AVK5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col4a6B1AVK5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col4a6B1AVK5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col4a6B1AVK5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col4a6B1AVK5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Col4a6B1AVK5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Col4a6B1AVK5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Col4a6B1AVK5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Col4a6B1AVK5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms