Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprsB0V2N1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprsB0V2N1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprsB0V2N1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtprsB0V2N1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PtprsB0V2N1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprsB0V2N1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprsB0V2N1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprsB0V2N1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprsB0V2N1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprsB0V2N1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprsB0V2N1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprsB0V2N1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprsB0V2N1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprsB0V2N1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprsB0V2N1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprsB0V2N1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprsB0V2N1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprsB0V2N1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprsB0V2N1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprsB0V2N1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprsB0V2N1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprsB0V2N1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprsB0V2N1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprsB0V2N1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprsB0V2N1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PtprsB0V2N1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtprsB0V2N1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtprsB0V2N1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtprsB0V2N1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprsB0V2N1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprsB0V2N1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprsB0V2N1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprsB0V2N1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprsB0V2N1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprsB0V2N1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprsB0V2N1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprsB0V2N1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprsB0V2N1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprsB0V2N1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprsB0V2N1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprsB0V2N1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprsB0V2N1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprsB0V2N1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprsB0V2N1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprsB0V2N1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprsB0V2N1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprsB0V2N1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprsB0V2N1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprsB0V2N1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprsB0V2N1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprsB0V2N1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprsB0V2N1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprsB0V2N1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprsB0V2N1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprsB0V2N1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprsB0V2N1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprsB0V2N1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprsB0V2N1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprsB0V2N1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprsB0V2N1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprsB0V2N1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprsB0V2N1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprsB0V2N1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprsB0V2N1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprsB0V2N1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprsB0V2N1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprsB0V2N1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprsB0V2N1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprsB0V2N1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprsB0V2N1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprsB0V2N1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprsB0V2N1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprsB0V2N1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprsB0V2N1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprsB0V2N1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprsB0V2N1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprsB0V2N1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprsB0V2N1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprsB0V2N1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprsB0V2N1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprsB0V2N1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprsB0V2N1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprsB0V2N1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprsB0V2N1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprsB0V2N1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprsB0V2N1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprsB0V2N1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprsB0V2N1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprsB0V2N1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprsB0V2N1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprsB0V2N1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprsB0V2N1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprsB0V2N1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprsB0V2N1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprsB0V2N1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprsB0V2N1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprsB0V2N1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprsB0V2N1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprsB0V2N1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.7 ms