Protein–RNA interactions for Protein: A2AVA0

Svep1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Svep1A2AVA0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Svep1A2AVA0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Svep1A2AVA0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Svep1A2AVA0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Svep1A2AVA0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Svep1A2AVA0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Svep1A2AVA0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Svep1A2AVA0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Svep1A2AVA0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Svep1A2AVA0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Svep1A2AVA0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Svep1A2AVA0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Svep1A2AVA0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Svep1A2AVA0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Svep1A2AVA0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Svep1A2AVA0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Svep1A2AVA0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Svep1A2AVA0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Svep1A2AVA0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Svep1A2AVA0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Svep1A2AVA0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Svep1A2AVA0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Svep1A2AVA0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Svep1A2AVA0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Svep1A2AVA0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Svep1A2AVA0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Svep1A2AVA0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Svep1A2AVA0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Svep1A2AVA0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Svep1A2AVA0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Svep1A2AVA0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Svep1A2AVA0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Svep1A2AVA0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Svep1A2AVA0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Svep1A2AVA0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Svep1A2AVA0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Svep1A2AVA0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Svep1A2AVA0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Svep1A2AVA0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Svep1A2AVA0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Svep1A2AVA0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Svep1A2AVA0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Svep1A2AVA0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Svep1A2AVA0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Svep1A2AVA0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Svep1A2AVA0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Svep1A2AVA0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Svep1A2AVA0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Svep1A2AVA0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Svep1A2AVA0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Svep1A2AVA0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Svep1A2AVA0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Svep1A2AVA0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Svep1A2AVA0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Svep1A2AVA0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Svep1A2AVA0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Svep1A2AVA0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Svep1A2AVA0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Svep1A2AVA0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Svep1A2AVA0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Svep1A2AVA0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Svep1A2AVA0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Svep1A2AVA0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Svep1A2AVA0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Svep1A2AVA0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Svep1A2AVA0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Svep1A2AVA0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Svep1A2AVA0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Svep1A2AVA0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Svep1A2AVA0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Svep1A2AVA0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Svep1A2AVA0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Svep1A2AVA0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Svep1A2AVA0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Svep1A2AVA0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Svep1A2AVA0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Svep1A2AVA0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Svep1A2AVA0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Svep1A2AVA0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Svep1A2AVA0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Svep1A2AVA0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Svep1A2AVA0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Svep1A2AVA0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Svep1A2AVA0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Svep1A2AVA0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Svep1A2AVA0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Svep1A2AVA0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Svep1A2AVA0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Svep1A2AVA0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Svep1A2AVA0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Svep1A2AVA0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Svep1A2AVA0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Svep1A2AVA0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Svep1A2AVA0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Svep1A2AVA0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Svep1A2AVA0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Svep1A2AVA0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Svep1A2AVA0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Svep1A2AVA0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Svep1A2AVA0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms