Protein–RNA interactions for Protein: A2ARK0

Fam83c, Protein FAM83C, mousemouse

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83cA2ARK0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam83cA2ARK0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam83cA2ARK0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fam83cA2ARK0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fam83cA2ARK0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam83cA2ARK0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam83cA2ARK0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam83cA2ARK0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam83cA2ARK0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam83cA2ARK0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam83cA2ARK0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam83cA2ARK0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam83cA2ARK0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam83cA2ARK0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam83cA2ARK0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam83cA2ARK0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam83cA2ARK0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam83cA2ARK0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam83cA2ARK0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam83cA2ARK0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam83cA2ARK0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam83cA2ARK0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam83cA2ARK0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam83cA2ARK0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam83cA2ARK0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam83cA2ARK0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam83cA2ARK0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam83cA2ARK0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam83cA2ARK0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam83cA2ARK0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam83cA2ARK0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam83cA2ARK0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam83cA2ARK0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam83cA2ARK0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam83cA2ARK0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam83cA2ARK0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam83cA2ARK0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam83cA2ARK0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam83cA2ARK0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam83cA2ARK0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam83cA2ARK0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam83cA2ARK0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam83cA2ARK0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam83cA2ARK0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam83cA2ARK0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam83cA2ARK0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam83cA2ARK0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam83cA2ARK0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam83cA2ARK0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam83cA2ARK0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam83cA2ARK0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam83cA2ARK0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam83cA2ARK0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam83cA2ARK0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam83cA2ARK0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam83cA2ARK0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam83cA2ARK0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam83cA2ARK0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam83cA2ARK0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam83cA2ARK0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam83cA2ARK0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam83cA2ARK0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam83cA2ARK0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam83cA2ARK0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam83cA2ARK0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam83cA2ARK0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam83cA2ARK0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam83cA2ARK0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam83cA2ARK0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam83cA2ARK0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam83cA2ARK0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam83cA2ARK0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam83cA2ARK0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam83cA2ARK0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam83cA2ARK0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam83cA2ARK0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam83cA2ARK0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam83cA2ARK0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam83cA2ARK0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam83cA2ARK0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam83cA2ARK0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam83cA2ARK0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam83cA2ARK0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam83cA2ARK0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam83cA2ARK0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam83cA2ARK0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam83cA2ARK0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam83cA2ARK0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam83cA2ARK0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam83cA2ARK0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam83cA2ARK0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam83cA2ARK0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Fam83cA2ARK0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam83cA2ARK0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam83cA2ARK0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam83cA2ARK0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam83cA2ARK0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam83cA2ARK0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam83cA2ARK0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam83cA2ARK0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms