Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Itga8A2ARA8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itga8A2ARA8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itga8A2ARA8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itga8A2ARA8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itga8A2ARA8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itga8A2ARA8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itga8A2ARA8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itga8A2ARA8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itga8A2ARA8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itga8A2ARA8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itga8A2ARA8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itga8A2ARA8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itga8A2ARA8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Itga8A2ARA8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Itga8A2ARA8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Itga8A2ARA8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Itga8A2ARA8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itga8A2ARA8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itga8A2ARA8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itga8A2ARA8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itga8A2ARA8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itga8A2ARA8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Itga8A2ARA8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Itga8A2ARA8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Itga8A2ARA8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itga8A2ARA8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itga8A2ARA8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itga8A2ARA8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Itga8A2ARA8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itga8A2ARA8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itga8A2ARA8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itga8A2ARA8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itga8A2ARA8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itga8A2ARA8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itga8A2ARA8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itga8A2ARA8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itga8A2ARA8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itga8A2ARA8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itga8A2ARA8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itga8A2ARA8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itga8A2ARA8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itga8A2ARA8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itga8A2ARA8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itga8A2ARA8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itga8A2ARA8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Itga8A2ARA8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itga8A2ARA8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itga8A2ARA8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itga8A2ARA8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itga8A2ARA8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itga8A2ARA8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itga8A2ARA8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itga8A2ARA8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itga8A2ARA8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itga8A2ARA8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itga8A2ARA8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itga8A2ARA8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itga8A2ARA8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itga8A2ARA8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itga8A2ARA8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itga8A2ARA8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itga8A2ARA8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itga8A2ARA8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itga8A2ARA8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itga8A2ARA8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itga8A2ARA8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Itga8A2ARA8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Itga8A2ARA8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Itga8A2ARA8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itga8A2ARA8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Itga8A2ARA8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itga8A2ARA8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itga8A2ARA8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itga8A2ARA8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itga8A2ARA8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itga8A2ARA8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Itga8A2ARA8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Itga8A2ARA8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Itga8A2ARA8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Itga8A2ARA8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itga8A2ARA8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itga8A2ARA8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itga8A2ARA8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Itga8A2ARA8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Itga8A2ARA8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Itga8A2ARA8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Itga8A2ARA8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itga8A2ARA8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itga8A2ARA8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itga8A2ARA8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itga8A2ARA8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itga8A2ARA8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itga8A2ARA8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itga8A2ARA8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itga8A2ARA8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Itga8A2ARA8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itga8A2ARA8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itga8A2ARA8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itga8A2ARA8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms