Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Syndig1A2ANU3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Syndig1A2ANU3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Syndig1A2ANU3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Syndig1A2ANU3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syndig1A2ANU3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syndig1A2ANU3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syndig1A2ANU3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Syndig1A2ANU3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Syndig1A2ANU3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Syndig1A2ANU3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Syndig1A2ANU3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Syndig1A2ANU3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Syndig1A2ANU3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syndig1A2ANU3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syndig1A2ANU3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syndig1A2ANU3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syndig1A2ANU3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syndig1A2ANU3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Syndig1A2ANU3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Syndig1A2ANU3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syndig1A2ANU3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syndig1A2ANU3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Syndig1A2ANU3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Syndig1A2ANU3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Syndig1A2ANU3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syndig1A2ANU3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syndig1A2ANU3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syndig1A2ANU3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Syndig1A2ANU3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Syndig1A2ANU3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Syndig1A2ANU3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Syndig1A2ANU3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Syndig1A2ANU3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Syndig1A2ANU3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Syndig1A2ANU3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syndig1A2ANU3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syndig1A2ANU3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syndig1A2ANU3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syndig1A2ANU3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syndig1A2ANU3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syndig1A2ANU3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Syndig1A2ANU3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Syndig1A2ANU3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Syndig1A2ANU3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Syndig1A2ANU3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Syndig1A2ANU3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Syndig1A2ANU3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Syndig1A2ANU3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syndig1A2ANU3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Syndig1A2ANU3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Syndig1A2ANU3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Syndig1A2ANU3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Syndig1A2ANU3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Syndig1A2ANU3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Syndig1A2ANU3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Syndig1A2ANU3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Syndig1A2ANU3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Syndig1A2ANU3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Syndig1A2ANU3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Syndig1A2ANU3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Syndig1A2ANU3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Syndig1A2ANU3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Syndig1A2ANU3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Syndig1A2ANU3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Syndig1A2ANU3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Syndig1A2ANU3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Syndig1A2ANU3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Syndig1A2ANU3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Syndig1A2ANU3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Syndig1A2ANU3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Syndig1A2ANU3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Syndig1A2ANU3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Syndig1A2ANU3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syndig1A2ANU3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syndig1A2ANU3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syndig1A2ANU3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syndig1A2ANU3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syndig1A2ANU3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Syndig1A2ANU3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Syndig1A2ANU3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Syndig1A2ANU3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Syndig1A2ANU3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Syndig1A2ANU3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Syndig1A2ANU3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Syndig1A2ANU3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Syndig1A2ANU3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syndig1A2ANU3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syndig1A2ANU3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Syndig1A2ANU3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Syndig1A2ANU3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Syndig1A2ANU3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Syndig1A2ANU3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Syndig1A2ANU3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Syndig1A2ANU3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Syndig1A2ANU3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Syndig1A2ANU3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Syndig1A2ANU3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syndig1A2ANU3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syndig1A2ANU3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms