Protein–RNA interactions for Protein: A1L3P4

Slc9a6, Sodium/hydrogen exchanger, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a6A1L3P4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc9a6A1L3P4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc9a6A1L3P4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc9a6A1L3P4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc9a6A1L3P4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc9a6A1L3P4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc9a6A1L3P4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slc9a6A1L3P4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc9a6A1L3P4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc9a6A1L3P4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc9a6A1L3P4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc9a6A1L3P4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc9a6A1L3P4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc9a6A1L3P4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc9a6A1L3P4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc9a6A1L3P4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc9a6A1L3P4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc9a6A1L3P4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc9a6A1L3P4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc9a6A1L3P4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc9a6A1L3P4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc9a6A1L3P4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc9a6A1L3P4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc9a6A1L3P4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc9a6A1L3P4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc9a6A1L3P4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc9a6A1L3P4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc9a6A1L3P4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc9a6A1L3P4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc9a6A1L3P4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc9a6A1L3P4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc9a6A1L3P4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc9a6A1L3P4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc9a6A1L3P4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc9a6A1L3P4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc9a6A1L3P4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc9a6A1L3P4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc9a6A1L3P4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc9a6A1L3P4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc9a6A1L3P4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc9a6A1L3P4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc9a6A1L3P4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc9a6A1L3P4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc9a6A1L3P4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc9a6A1L3P4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc9a6A1L3P4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc9a6A1L3P4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc9a6A1L3P4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc9a6A1L3P4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc9a6A1L3P4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc9a6A1L3P4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc9a6A1L3P4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc9a6A1L3P4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc9a6A1L3P4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc9a6A1L3P4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc9a6A1L3P4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc9a6A1L3P4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc9a6A1L3P4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc9a6A1L3P4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc9a6A1L3P4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc9a6A1L3P4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc9a6A1L3P4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc9a6A1L3P4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc9a6A1L3P4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc9a6A1L3P4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc9a6A1L3P4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc9a6A1L3P4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc9a6A1L3P4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc9a6A1L3P4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc9a6A1L3P4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc9a6A1L3P4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc9a6A1L3P4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc9a6A1L3P4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc9a6A1L3P4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc9a6A1L3P4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc9a6A1L3P4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc9a6A1L3P4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Slc9a6A1L3P4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc9a6A1L3P4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc9a6A1L3P4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc9a6A1L3P4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc9a6A1L3P4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc9a6A1L3P4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc9a6A1L3P4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc9a6A1L3P4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc9a6A1L3P4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc9a6A1L3P4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc9a6A1L3P4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc9a6A1L3P4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc9a6A1L3P4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc9a6A1L3P4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc9a6A1L3P4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc9a6A1L3P4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc9a6A1L3P4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc9a6A1L3P4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc9a6A1L3P4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc9a6A1L3P4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc9a6A1L3P4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc9a6A1L3P4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc9a6A1L3P4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms