Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lama1P19137 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lama1P19137 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lama1P19137 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lama1P19137 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms