Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spi1P17433 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Spi1P17433 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Spi1P17433 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spi1P17433 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spi1P17433 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spi1P17433 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spi1P17433 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spi1P17433 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spi1P17433 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spi1P17433 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Spi1P17433 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Spi1P17433 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spi1P17433 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spi1P17433 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spi1P17433 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spi1P17433 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spi1P17433 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spi1P17433 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Spi1P17433 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Spi1P17433 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Spi1P17433 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spi1P17433 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spi1P17433 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spi1P17433 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spi1P17433 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spi1P17433 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spi1P17433 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Spi1P17433 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spi1P17433 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spi1P17433 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Spi1P17433 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spi1P17433 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spi1P17433 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spi1P17433 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Spi1P17433 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spi1P17433 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Spi1P17433 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spi1P17433 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spi1P17433 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Spi1P17433 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Spi1P17433 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spi1P17433 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spi1P17433 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spi1P17433 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Spi1P17433 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Spi1P17433 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Spi1P17433 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spi1P17433 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spi1P17433 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spi1P17433 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spi1P17433 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spi1P17433 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Spi1P17433 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spi1P17433 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spi1P17433 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spi1P17433 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spi1P17433 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spi1P17433 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Spi1P17433 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spi1P17433 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spi1P17433 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spi1P17433 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Spi1P17433 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Spi1P17433 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Spi1P17433 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Spi1P17433 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spi1P17433 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spi1P17433 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spi1P17433 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spi1P17433 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spi1P17433 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spi1P17433 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spi1P17433 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spi1P17433 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spi1P17433 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spi1P17433 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spi1P17433 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spi1P17433 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spi1P17433 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Spi1P17433 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spi1P17433 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spi1P17433 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spi1P17433 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spi1P17433 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spi1P17433 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spi1P17433 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spi1P17433 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spi1P17433 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spi1P17433 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spi1P17433 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spi1P17433 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Spi1P17433 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spi1P17433 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spi1P17433 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Spi1P17433 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spi1P17433 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Spi1P17433 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spi1P17433 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spi1P17433 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms