Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tspan11Q9D1D1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tspan11Q9D1D1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tspan11Q9D1D1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tspan11Q9D1D1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tspan11Q9D1D1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tspan11Q9D1D1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tspan11Q9D1D1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tspan11Q9D1D1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tspan11Q9D1D1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tspan11Q9D1D1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tspan11Q9D1D1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tspan11Q9D1D1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tspan11Q9D1D1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tspan11Q9D1D1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tspan11Q9D1D1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tspan11Q9D1D1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tspan11Q9D1D1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tspan11Q9D1D1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tspan11Q9D1D1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspan11Q9D1D1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspan11Q9D1D1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspan11Q9D1D1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspan11Q9D1D1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspan11Q9D1D1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspan11Q9D1D1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspan11Q9D1D1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspan11Q9D1D1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspan11Q9D1D1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspan11Q9D1D1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspan11Q9D1D1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspan11Q9D1D1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspan11Q9D1D1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspan11Q9D1D1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspan11Q9D1D1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms