Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mre11Q61216 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mre11Q61216 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms