Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
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Nkx6-3Q3UHX8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Nkx6-3Q3UHX8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Nkx6-3Q3UHX8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Nkx6-3Q3UHX8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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