Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Defa11P50709 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Defa11P50709 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Defa11P50709 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Defa11P50709 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Defa11P50709 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Defa11P50709 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Defa11P50709 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Defa11P50709 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Defa11P50709 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Defa11P50709 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Defa11P50709 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Defa11P50709 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Defa11P50709 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Defa11P50709 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Defa11P50709 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Defa11P50709 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Defa11P50709 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Defa11P50709 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Defa11P50709 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Defa11P50709 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Defa11P50709 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Defa11P50709 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Defa11P50709 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Defa11P50709 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Defa11P50709 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Defa11P50709 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Defa11P50709 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa11P50709 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa11P50709 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Defa11P50709 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms