Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spi1P17433 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spi1P17433 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Spi1P17433 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spi1P17433 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spi1P17433 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spi1P17433 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spi1P17433 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms