Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG1

Edf1, Endothelial differentiation-related factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edf1Q9JMG1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Edf1Q9JMG1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Edf1Q9JMG1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms