Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms