Protein–RNA interactions for Protein: Q497Q6

Fam228b, Protein FAM228B, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228bQ497Q6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam228bQ497Q6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam228bQ497Q6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam228bQ497Q6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam228bQ497Q6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam228bQ497Q6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam228bQ497Q6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Fam228bQ497Q6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Fam228bQ497Q6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Fam228bQ497Q6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Fam228bQ497Q6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Fam228bQ497Q6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam228bQ497Q6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam228bQ497Q6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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