Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Nkx6-3Q3UHX8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Nkx6-3Q3UHX8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Nkx6-3Q3UHX8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms