Protein–RNA interactions for Protein: P51670

Ccl9, C-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl9P51670 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl9P51670 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl9P51670 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl9P51670 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl9P51670 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl9P51670 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl9P51670 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl9P51670 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl9P51670 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl9P51670 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl9P51670 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl9P51670 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl9P51670 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl9P51670 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl9P51670 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl9P51670 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl9P51670 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl9P51670 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl9P51670 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl9P51670 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl9P51670 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl9P51670 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl9P51670 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl9P51670 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl9P51670 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl9P51670 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl9P51670 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl9P51670 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl9P51670 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl9P51670 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl9P51670 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl9P51670 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl9P51670 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl9P51670 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl9P51670 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl9P51670 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl9P51670 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl9P51670 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl9P51670 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl9P51670 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl9P51670 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl9P51670 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl9P51670 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl9P51670 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl9P51670 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms