Protein–RNA interactions for Protein: Q9R000

Itgb1bp2, Integrin beta-1-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1bp2Q9R000 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb1bp2Q9R000 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Itgb1bp2Q9R000 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Itgb1bp2Q9R000 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb1bp2Q9R000 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms