Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BckdkO55028 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BckdkO55028 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BckdkO55028 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BckdkO55028 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BckdkO55028 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BckdkO55028 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
BckdkO55028 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BckdkO55028 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BckdkO55028 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BckdkO55028 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BckdkO55028 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BckdkO55028 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BckdkO55028 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BckdkO55028 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BckdkO55028 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms