Protein–RNA interactions for Protein: O35551

Rabep1, Rab GTPase-binding effector protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabep1O35551 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rabep1O35551 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rabep1O35551 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
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