Protein–RNA interactions for Protein: F8VPJ6

Rfx7, Regulatory factor X, 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx7F8VPJ6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rfx7F8VPJ6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Rfx7F8VPJ6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rfx7F8VPJ6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rfx7F8VPJ6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rfx7F8VPJ6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rfx7F8VPJ6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rfx7F8VPJ6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rfx7F8VPJ6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rfx7F8VPJ6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Rfx7F8VPJ6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rfx7F8VPJ6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rfx7F8VPJ6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rfx7F8VPJ6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rfx7F8VPJ6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rfx7F8VPJ6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rfx7F8VPJ6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rfx7F8VPJ6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rfx7F8VPJ6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rfx7F8VPJ6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rfx7F8VPJ6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rfx7F8VPJ6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rfx7F8VPJ6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rfx7F8VPJ6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rfx7F8VPJ6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rfx7F8VPJ6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Rfx7F8VPJ6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rfx7F8VPJ6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rfx7F8VPJ6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rfx7F8VPJ6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rfx7F8VPJ6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rfx7F8VPJ6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rfx7F8VPJ6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rfx7F8VPJ6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rfx7F8VPJ6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Rfx7F8VPJ6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rfx7F8VPJ6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rfx7F8VPJ6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rfx7F8VPJ6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rfx7F8VPJ6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rfx7F8VPJ6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rfx7F8VPJ6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms