Protein–RNA interactions for Protein: Q60753

Ctf1, Cardiotrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctf1Q60753 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ctf1Q60753 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctf1Q60753 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctf1Q60753 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ctf1Q60753 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctf1Q60753 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctf1Q60753 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctf1Q60753 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctf1Q60753 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctf1Q60753 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctf1Q60753 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctf1Q60753 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctf1Q60753 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctf1Q60753 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctf1Q60753 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctf1Q60753 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctf1Q60753 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctf1Q60753 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctf1Q60753 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctf1Q60753 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctf1Q60753 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctf1Q60753 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ctf1Q60753 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctf1Q60753 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctf1Q60753 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctf1Q60753 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctf1Q60753 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctf1Q60753 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctf1Q60753 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ctf1Q60753 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctf1Q60753 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctf1Q60753 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctf1Q60753 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctf1Q60753 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctf1Q60753 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ctf1Q60753 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctf1Q60753 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctf1Q60753 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctf1Q60753 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctf1Q60753 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctf1Q60753 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctf1Q60753 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctf1Q60753 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctf1Q60753 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctf1Q60753 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctf1Q60753 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctf1Q60753 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctf1Q60753 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctf1Q60753 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctf1Q60753 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctf1Q60753 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ctf1Q60753 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctf1Q60753 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctf1Q60753 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctf1Q60753 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctf1Q60753 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ctf1Q60753 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctf1Q60753 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctf1Q60753 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctf1Q60753 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctf1Q60753 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ctf1Q60753 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctf1Q60753 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctf1Q60753 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctf1Q60753 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctf1Q60753 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctf1Q60753 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctf1Q60753 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctf1Q60753 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctf1Q60753 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctf1Q60753 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctf1Q60753 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctf1Q60753 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctf1Q60753 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctf1Q60753 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctf1Q60753 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctf1Q60753 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctf1Q60753 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctf1Q60753 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctf1Q60753 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctf1Q60753 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctf1Q60753 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctf1Q60753 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctf1Q60753 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctf1Q60753 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctf1Q60753 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctf1Q60753 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctf1Q60753 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctf1Q60753 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctf1Q60753 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctf1Q60753 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctf1Q60753 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctf1Q60753 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ctf1Q60753 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctf1Q60753 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctf1Q60753 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ctf1Q60753 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ctf1Q60753 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctf1Q60753 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctf1Q60753 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms