Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stx12Q9ER00 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms