Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gtpbp4Q99ME9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtpbp4Q99ME9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms