Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MitfQ08874 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MitfQ08874 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MitfQ08874 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MitfQ08874 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MitfQ08874 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MitfQ08874 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MitfQ08874 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MitfQ08874 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms