Protein–RNA interactions for Protein: Q3UST5

UPF0764 protein C16orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UST5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3UST5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3UST5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3UST5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3UST5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3UST5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3UST5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3UST5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3UST5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3UST5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3UST5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3UST5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3UST5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3UST5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3UST5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3UST5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3UST5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3UST5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3UST5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3UST5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3UST5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3UST5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3UST5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3UST5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3UST5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3UST5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3UST5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3UST5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q3UST5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q3UST5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q3UST5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q3UST5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q3UST5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Q3UST5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q3UST5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q3UST5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q3UST5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q3UST5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q3UST5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q3UST5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q3UST5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q3UST5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q3UST5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Q3UST5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q3UST5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q3UST5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q3UST5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3UST5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3UST5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3UST5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3UST5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3UST5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3UST5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3UST5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3UST5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3UST5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3UST5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3UST5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3UST5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3UST5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3UST5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3UST5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3UST5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3UST5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3UST5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3UST5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3UST5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3UST5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3UST5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3UST5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3UST5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3UST5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3UST5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3UST5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3UST5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3UST5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3UST5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3UST5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3UST5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3UST5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3UST5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3UST5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3UST5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3UST5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3UST5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3UST5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3UST5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3UST5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3UST5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3UST5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3UST5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3UST5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3UST5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3UST5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3UST5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3UST5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3UST5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3UST5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3UST5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3UST5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms