Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psmb10O35955 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmb10O35955 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmb10O35955 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmb10O35955 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmb10O35955 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmb10O35955 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmb10O35955 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmb10O35955 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmb10O35955 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmb10O35955 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmb10O35955 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmb10O35955 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmb10O35955 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb10O35955 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb10O35955 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb10O35955 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb10O35955 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb10O35955 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb10O35955 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb10O35955 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb10O35955 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb10O35955 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb10O35955 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb10O35955 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb10O35955 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb10O35955 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb10O35955 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb10O35955 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmb10O35955 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psmb10O35955 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psmb10O35955 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psmb10O35955 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psmb10O35955 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psmb10O35955 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psmb10O35955 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.8 ms